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Statistical DIGE Analyzer (SDA)

Einführung und Features

Der MPC Statistical DIGE Analyzer ist ein Java Programm zur statistischen Analyse der 2-dimensionalen Differenz Gel Elektrophorese (DIGE). Er wurde von Dr. Klaus Jung am Medizinischen Proteom-Center (Prof. Dr. Helmut E. Mayer) der Ruhr-Universität Bochum entwickelt. Die Software umfasst folgende Merkmale:
- Gleichzeitige Differentialanalyse von Tausenden Protein-Spots: t-tests, fold change (plus die dazugehörigen Konfidenzintervalle), p-value Korrekturen (Bonferroni, Benjamini-Hochberg).
- Power Analyse zur Berechnung der Stichprobengröße.
- Hauptkomponentenanalyse zum Vergleich der Gel Variation.
- Analyse von 'Minimal' und 'Saturation' designed Studien.
- Kalibration der raw spot Intensitäten (Quantil Normalisierung).

System- & Hardwareanforderungen

Diese Applikation läuft auf jedem Java fähigen Rechner. Die letzte Java-version kann von http://www.java.com/de/ heruntergeladen werden

Download & Installation

Um diese Applikation zu benutzen downloaden Sie bitte die .rar-Datei und entpacken diese in das gewünschte Verzeichnis auf Ihrem Computer. Die -rar-Datei kann mit Hilfe des Programms WinRAR entpackt werden. Starten Sie dann die Applikation durch Öffnen der SDA.jar - Datei im Hauptverzeichnis.

Sda-1-0-beta Me Kp   (262.6 kB)

Dokumentation

Userguide-sda-1-0   (58.8 kB)

Kontakt

Michael Kohl (E-Mail: michael.kohl:at:rub.de)