DecoyDatabaseBuilder (ein PeakQuant Modul)

DecoyDatabaseBuilder ist ein Modul der PeakQuant software; es ermöglicht die Erzeugung von Decoy-Sequenzen für Aminosäure-Datenbanken.

Es ist in Java (Version 1.5.x oder höher ist erforderlich für Microsoft Windows; Java 1.6.x oder höher für Linux und Apple) geschrieben.

Im Moment ist die DecoyDatabaseBuilder-Software frei erhältlich und frei für nicht-kommerzielle Zwecke.

Hinweis: Bei der Benutzung von 32-Bit versionen von Java kommt es zu fatalen Exceptions. Bitte verwenden Sie die 64-Bit Version und vergessen Sie nicht, die Hilfe-Anwendung des Browsers für .JNLP-Dateien zu ändern.

Wenn Sie den DecoyDatabaseBuilder verwenden, um Resultate zu veröffentlichen, dann zitieren Sie bitte die Referenz zu folgenden Paper:

"Reidegeld KA, Eisenacher M, Kohl M, Chamrad D, Körting G, Blüggel M, Meyer HE, Stephan C (2008): An easy-to-use Decoy Database Builder software tool, implementing different decoy strategies for false discovery rate calculation in automated MS/MS protein identifications. Proteomics 2008 Mar;8(6):1129-37" [PubMed ID: 18338823]


Im Moment ist die DecoyDatabaseBuilder Software offentlich erhältlich und frei für nicht-kommerzielle Zwecke.

Um DecoyDatabaseBuilder als local installierte Version zu benutzen, unzip in ein beliebiges Verzeichnis, z.B.  "C:\DecoyDatabaseBuilder \" und doppel-clicke DecoyDatabaseBuilder .jar:

download DecoyDatabaseBuilder dist_1_5_47.zip (local jar after unzip, version 1.5.47)

Kontaktperson: Martin Eisenacher